Quatre ans après la demande divorce avec son ex-épouse, Christine, en 2014, un juge a finalement traité l'affaire de Thomas Gibson. Celui-ci devra ainsi venir en aide financièrement aux trois enfants du couple : Agatha, Travis et James.
Dans un entretien, l'acteur a déclaré : "Être un père est la plus grande expérience de ma vie. Je suis l'enfant du divorce, et lorsque Christine et moi nous nous sommes mariés, il était important pour moi de ne jamais compromettre notre mariage. Nous avons passé un an et demi en médiation. Nous l'avons gardé privé parce que le divorce est assez dur pour les enfants sans avoir à le traiter publiquement. Christine et moi sommes restés avec nos enfants à San Antonio. Nous avons fait de notre mieux et nous continuons à faire de notre mieux en tant que parents".
Mariés depuis vingt ans, Thomas Gibson et sa femme se sont mariés en 1993 et ont entamé une démarche de séparation en 2011.